中芯一號育種芯片

“中芯一號”以江西農業大學黃路生院士團隊研究成果為基礎,并集成了南京農業大學、中國農業大學、北京畜牧獸醫研究所、華中農業大學等國內12所豬基因組研究領域高校及科研院所最新成果。用于家豬基因組育種研究和應用,為打造“華系種豬”品牌提供技術保障。北京康普森生物技術有限公司為“中芯一號”唯一授權備貨公司。

 

芯片設計特點


先進性

  • 按功能區分標記類型:因果突變、緊密關聯、一般關聯、基因組分布點

  • 包含控制重組率基因:可通過重組增大表型變異,增加遺傳進展

  • 因果基因效應已知:部分功能檢測不需要構建參考群,新測表型可納入現有參考群中更新效應

  • 芯片可升級:可依據增測的表型數據和填充后的基因組全序列不斷增加因果位點和緊密關聯點數目,升級芯片

  • 考慮冷熱點:考慮重組冷熱點,設計芯片分布密度

  • 評估方法先進:可根據標記效應給予權重或自定義權重計算出親緣關系矩陣,估算的顯性效應能有效用于個體選配方案制定


全面性

  • 評估群體全面:杜長大、F2 資源家系、兩頭烏、蘇太、嵌合家系、萊蕪、二花臉、巴馬香、疝氣等9 個群體作為參考群

  • 評估性狀全面:涵蓋從出生到屠宰整個生育期的繁殖、生長肥育、胴體、肉質、免疫等7 大類422個性狀

  • 單倍型庫全面:目前已有涵蓋杜、長、大主要商業品種及中國六大類地方品種高覆蓋度的基因組全序列單倍型庫


 

Credit analysis

芯片應用場景    

  • 育種應用 /Breeding applications                    
                       
    基因組選擇
    親緣關系鑒定
    經濟性狀評估
  • 基礎科研 /Basic research                    
                       
    全基因組關聯分析(GWAS 分析)
    全基因組連鎖分析(QTL 分析)
    精細定位
    群體遺傳學分析(進化、馴養、遺傳多樣性)
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